Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms