Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fcer1aP20489 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms