Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms