Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou5f1P20263 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms