Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VimP20152 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VimP20152 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VimP20152 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VimP20152 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VimP20152 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VimP20152 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VimP20152 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VimP20152 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VimP20152 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VimP20152 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VimP20152 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VimP20152 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VimP20152 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VimP20152 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VimP20152 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VimP20152 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VimP20152 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VimP20152 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VimP20152 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VimP20152 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VimP20152 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VimP20152 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VimP20152 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VimP20152 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VimP20152 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VimP20152 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VimP20152 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VimP20152 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VimP20152 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VimP20152 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VimP20152 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VimP20152 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VimP20152 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VimP20152 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VimP20152 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VimP20152 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VimP20152 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VimP20152 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VimP20152 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VimP20152 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms