Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NefhP19246 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NefhP19246 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NefhP19246 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NefhP19246 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NefhP19246 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NefhP19246 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NefhP19246 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NefhP19246 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NefhP19246 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NefhP19246 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NefhP19246 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NefhP19246 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NefhP19246 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NefhP19246 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NefhP19246 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NefhP19246 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NefhP19246 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NefhP19246 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NefhP19246 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NefhP19246 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NefhP19246 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NefhP19246 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NefhP19246 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NefhP19246 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NefhP19246 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NefhP19246 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NefhP19246 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NefhP19246 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NefhP19246 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NefhP19246 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NefhP19246 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NefhP19246 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NefhP19246 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NefhP19246 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NefhP19246 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NefhP19246 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NefhP19246 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NefhP19246 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NefhP19246 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NefhP19246 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NefhP19246 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NefhP19246 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NefhP19246 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NefhP19246 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NefhP19246 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NefhP19246 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NefhP19246 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NefhP19246 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NefhP19246 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NefhP19246 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NefhP19246 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NefhP19246 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NefhP19246 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NefhP19246 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms