Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms