Protein–RNA interactions for Protein: P18608

Hmgn1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn1P18608 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn1P18608 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn1P18608 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms