Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpraP18052 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpraP18052 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpraP18052 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpraP18052 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtpraP18052 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpraP18052 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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