Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra6P16305 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms