Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rag1P15919 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rag1P15919 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rag1P15919 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rag1P15919 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms