Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd44P15379 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd44P15379 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms