Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd5P13379 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd5P13379 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd5P13379 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd5P13379 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms