Protein–RNA interactions for Protein: P12815

Pdcd6, Programmed cell death protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6P12815 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdcd6P12815 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdcd6P12815 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms