Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga5P11688 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga5P11688 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga5P11688 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga5P11688 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga5P11688 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms