Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd1d1P11609 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms