Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms