Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsbP10605 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsbP10605 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CtsbP10605 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsbP10605 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsbP10605 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsbP10605 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsbP10605 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms