Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PolP10400 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PolP10400 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PolP10400 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PolP10400 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PolP10400 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PolP10400 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
PolP10400 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PolP10400 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP10400 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP10400 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP10400 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP10400 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP10400 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP10400 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP10400 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP10400 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP10400 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP10400 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP10400 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PolP10400 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PolP10400 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PolP10400 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms