Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd8bP10300 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms