Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnmt3cP0DOY1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3cP0DOY1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms