Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf1P09925 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf1P09925 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf1P09925 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf1P09925 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf1P09925 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Surf1P09925 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Surf1P09925 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Surf1P09925 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Surf1P09925 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Surf1P09925 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Surf1P09925 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Surf1P09925 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Surf1P09925 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Surf1P09925 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Surf1P09925 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Surf1P09925 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Surf1P09925 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Surf1P09925 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Surf1P09925 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Surf1P09925 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms