Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxa1P09022 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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