Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NefmP08553 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NefmP08553 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NefmP08553 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NefmP08553 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NefmP08553 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NefmP08553 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefmP08553 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefmP08553 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefmP08553 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefmP08553 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefmP08553 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefmP08553 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefmP08553 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NefmP08553 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefmP08553 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefmP08553 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefmP08553 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefmP08553 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NefmP08553 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NefmP08553 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NefmP08553 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NefmP08553 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NefmP08553 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NefmP08553 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NefmP08553 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NefmP08553 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NefmP08553 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NefmP08553 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NefmP08553 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NefmP08553 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NefmP08553 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NefmP08553 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NefmP08553 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NefmP08553 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NefmP08553 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
NefmP08553 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NefmP08553 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NefmP08553 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NefmP08553 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NefmP08553 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NefmP08553 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NefmP08553 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NefmP08553 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NefmP08553 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NefmP08553 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NefmP08553 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NefmP08553 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NefmP08553 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NefmP08553 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NefmP08553 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NefmP08553 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NefmP08553 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NefmP08553 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NefmP08553 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NefmP08553 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NefmP08553 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NefmP08553 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefmP08553 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefmP08553 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefmP08553 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefmP08553 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefmP08553 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefmP08553 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefmP08553 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefmP08553 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NefmP08553 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefmP08553 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefmP08553 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefmP08553 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefmP08553 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefmP08553 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefmP08553 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NefmP08553 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NefmP08553 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NefmP08553 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NefmP08553 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NefmP08553 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NefmP08553 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NefmP08553 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NefmP08553 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NefmP08553 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NefmP08553 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NefmP08553 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NefmP08553 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NefmP08553 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NefmP08553 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NefmP08553 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NefmP08553 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NefmP08553 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NefmP08553 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NefmP08553 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NefmP08553 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NefmP08553 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NefmP08553 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NefmP08553 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NefmP08553 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NefmP08553 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NefmP08553 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NefmP08553 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms