Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TtrP07309 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtrP07309 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtrP07309 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TtrP07309 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TtrP07309 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TtrP07309 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TtrP07309 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TtrP07309 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms