Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06335 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06335 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06335 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06335 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06335 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06335 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06335 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06335 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06335 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06335 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06335 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06335 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06335 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06335 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06335 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06335 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06335 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06335 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06335 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
P06335 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P06335 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P06335 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06335 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06335 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms