Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcrg-V1P06325 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcrg-V1P06325 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcrg-V1P06325 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms