Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06323 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06323 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06323 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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