Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JunP05627 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JunP05627 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JunP05627 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JunP05627 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JunP05627 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JunP05627 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JunP05627 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
JunP05627 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JunP05627 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JunP05627 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JunP05627 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JunP05627 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JunP05627 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JunP05627 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JunP05627 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JunP05627 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JunP05627 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JunP05627 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JunP05627 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JunP05627 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JunP05627 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JunP05627 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JunP05627 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JunP05627 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JunP05627 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JunP05627 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JunP05627 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JunP05627 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JunP05627 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JunP05627 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JunP05627 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JunP05627 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
JunP05627 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JunP05627 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JunP05627 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JunP05627 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
JunP05627 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JunP05627 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JunP05627 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
JunP05627 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JunP05627 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JunP05627 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
JunP05627 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
JunP05627 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JunP05627 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JunP05627 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JunP05627 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JunP05627 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
JunP05627 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JunP05627 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
JunP05627 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
JunP05627 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
JunP05627 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JunP05627 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JunP05627 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JunP05627 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
JunP05627 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JunP05627 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JunP05627 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JunP05627 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JunP05627 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JunP05627 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms