Protein–RNA interactions for Protein: P05367

Saa2, Serum amyloid A-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa2P05367 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa2P05367 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms