Protein–RNA interactions for Protein: P05366

Saa1, Serum amyloid A-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa1P05366 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa1P05366 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa1P05366 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa1P05366 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa1P05366 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa1P05366 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa1P05366 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa1P05366 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa1P05366 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa1P05366 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa1P05366 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa1P05366 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Saa1P05366 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Saa1P05366 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Saa1P05366 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Saa1P05366 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Saa1P05366 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Saa1P05366 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Saa1P05366 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Saa1P05366 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa1P05366 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Saa1P05366 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Saa1P05366 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Saa1P05366 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Saa1P05366 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa1P05366 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa1P05366 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Saa1P05366 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa1P05366 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Saa1P05366 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa1P05366 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa1P05366 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa1P05366 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa1P05366 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms