Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04212 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04212 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04212 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04212 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04212 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04212 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P04212 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04212 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04212 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04212 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04212 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04212 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04212 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04212 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04212 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04212 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04212 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04212 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P04212 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04212 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04212 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04212 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04212 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P04212 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P04212 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P04212 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04212 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04212 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04212 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04212 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04212 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04212 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04212 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04212 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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