Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms