Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01797 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01797 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01797 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01797 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01797 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01797 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01797 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01797 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01797 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01797 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01797 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01797 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01797 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01797 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01797 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01797 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01797 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01797 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01797 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01797 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01797 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01797 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01797 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01797 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01797 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01797 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01797 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01797 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01797 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01797 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01797 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01797 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01797 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01797 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01797 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01797 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01797 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01797 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01797 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01797 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01797 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01797 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01797 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01797 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01797 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01797 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01797 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01797 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01797 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms