Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01658 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01658 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01658 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01658 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01658 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01658 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01658 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01658 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01658 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01658 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01658 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01658 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01658 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01658 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01658 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01658 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01658 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01658 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01658 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01658 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01658 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01658 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01658 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01658 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01658 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01658 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01658 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01658 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01658 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01658 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01658 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01658 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms