Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp8O89110 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp8O89110 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp8O89110 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Casp8O89110 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp8O89110 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp8O89110 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp8O89110 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms