Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl20O89093 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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