Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JtbO88824 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JtbO88824 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JtbO88824 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JtbO88824 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JtbO88824 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JtbO88824 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JtbO88824 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JtbO88824 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JtbO88824 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JtbO88824 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JtbO88824 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JtbO88824 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JtbO88824 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JtbO88824 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JtbO88824 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JtbO88824 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JtbO88824 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JtbO88824 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JtbO88824 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JtbO88824 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JtbO88824 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JtbO88824 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JtbO88824 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JtbO88824 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JtbO88824 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JtbO88824 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JtbO88824 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JtbO88824 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JtbO88824 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JtbO88824 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JtbO88824 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JtbO88824 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JtbO88824 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JtbO88824 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JtbO88824 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JtbO88824 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JtbO88824 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JtbO88824 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JtbO88824 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JtbO88824 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JtbO88824 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JtbO88824 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JtbO88824 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JtbO88824 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JtbO88824 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
JtbO88824 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JtbO88824 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JtbO88824 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
JtbO88824 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JtbO88824 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JtbO88824 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JtbO88824 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JtbO88824 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JtbO88824 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JtbO88824 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JtbO88824 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JtbO88824 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JtbO88824 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JtbO88824 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JtbO88824 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JtbO88824 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JtbO88824 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JtbO88824 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JtbO88824 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JtbO88824 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JtbO88824 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms