Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BlmO88700 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BlmO88700 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BlmO88700 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BlmO88700 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BlmO88700 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BlmO88700 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BlmO88700 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BlmO88700 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BlmO88700 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BlmO88700 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
BlmO88700 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BlmO88700 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BlmO88700 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BlmO88700 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BlmO88700 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BlmO88700 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BlmO88700 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BlmO88700 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BlmO88700 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BlmO88700 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BlmO88700 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BlmO88700 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BlmO88700 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BlmO88700 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BlmO88700 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BlmO88700 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BlmO88700 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BlmO88700 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BlmO88700 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BlmO88700 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BlmO88700 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BlmO88700 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BlmO88700 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BlmO88700 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BlmO88700 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BlmO88700 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BlmO88700 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BlmO88700 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BlmO88700 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BlmO88700 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BlmO88700 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BlmO88700 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BlmO88700 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BlmO88700 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BlmO88700 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BlmO88700 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BlmO88700 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BlmO88700 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BlmO88700 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BlmO88700 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BlmO88700 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BlmO88700 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BlmO88700 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BlmO88700 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BlmO88700 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BlmO88700 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BlmO88700 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BlmO88700 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BlmO88700 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BlmO88700 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BlmO88700 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BlmO88700 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BlmO88700 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BlmO88700 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BlmO88700 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BlmO88700 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BlmO88700 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BlmO88700 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BlmO88700 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BlmO88700 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BlmO88700 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BlmO88700 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BlmO88700 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BlmO88700 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BlmO88700 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BlmO88700 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BlmO88700 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BlmO88700 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BlmO88700 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BlmO88700 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BlmO88700 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BlmO88700 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BlmO88700 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BlmO88700 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BlmO88700 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BlmO88700 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BlmO88700 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BlmO88700 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BlmO88700 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BlmO88700 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BlmO88700 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BlmO88700 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BlmO88700 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BlmO88700 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BlmO88700 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BlmO88700 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BlmO88700 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BlmO88700 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BlmO88700 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms