Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmx1bO88609 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms