Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnmt3bO88509 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms