Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnmt3aO88508 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms