Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AvilO88398 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AvilO88398 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AvilO88398 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AvilO88398 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AvilO88398 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AvilO88398 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AvilO88398 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AvilO88398 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AvilO88398 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AvilO88398 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AvilO88398 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AvilO88398 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AvilO88398 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AvilO88398 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AvilO88398 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AvilO88398 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AvilO88398 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AvilO88398 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AvilO88398 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AvilO88398 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AvilO88398 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AvilO88398 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AvilO88398 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AvilO88398 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AvilO88398 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AvilO88398 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AvilO88398 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AvilO88398 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AvilO88398 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AvilO88398 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AvilO88398 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AvilO88398 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AvilO88398 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AvilO88398 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AvilO88398 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AvilO88398 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AvilO88398 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AvilO88398 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AvilO88398 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AvilO88398 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AvilO88398 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AvilO88398 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms