Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt1O88346 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms