Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctnnal1O88327 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnal1O88327 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms