Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nid2O88322 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nid2O88322 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nid2O88322 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nid2O88322 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nid2O88322 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nid2O88322 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nid2O88322 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms