Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfdp1O88271 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms