Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SfnO70456 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SfnO70456 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SfnO70456 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SfnO70456 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SfnO70456 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SfnO70456 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SfnO70456 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SfnO70456 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SfnO70456 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SfnO70456 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SfnO70456 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SfnO70456 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SfnO70456 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SfnO70456 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SfnO70456 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SfnO70456 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SfnO70456 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SfnO70456 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SfnO70456 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SfnO70456 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SfnO70456 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SfnO70456 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SfnO70456 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SfnO70456 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SfnO70456 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SfnO70456 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SfnO70456 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SfnO70456 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SfnO70456 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SfnO70456 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SfnO70456 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SfnO70456 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SfnO70456 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SfnO70456 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SfnO70456 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SfnO70456 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SfnO70456 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SfnO70456 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SfnO70456 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SfnO70456 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SfnO70456 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SfnO70456 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SfnO70456 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SfnO70456 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SfnO70456 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SfnO70456 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SfnO70456 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SfnO70456 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SfnO70456 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SfnO70456 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SfnO70456 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SfnO70456 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SfnO70456 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SfnO70456 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SfnO70456 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SfnO70456 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SfnO70456 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SfnO70456 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SfnO70456 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SfnO70456 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SfnO70456 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SfnO70456 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SfnO70456 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SfnO70456 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SfnO70456 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SfnO70456 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SfnO70456 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SfnO70456 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SfnO70456 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SfnO70456 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SfnO70456 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SfnO70456 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SfnO70456 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SfnO70456 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SfnO70456 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SfnO70456 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SfnO70456 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SfnO70456 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SfnO70456 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SfnO70456 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SfnO70456 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms