Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itgb5O70309 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb5O70309 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms