Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfi1bO70237 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfi1bO70237 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms